Imagerie couleur basique avec ImageJ

Mardi 20 mai 2008

Imagerie couleur basique avec ImageJ

ImageJ
ImageJ est un logiciel gratuit développé par le National Institute of Health. Il est plutôt adapté aux biosciences, et il est beaucoup utilisé pour traiter et analyser les images de microscopie. Il est très complet et peut facilement être utilisé par les astronomes amateurs.
ImageJ est developpé en Java et il est donc multi-plateforme. Enfin il est assez facile de créer ses propres macros (langage macro très simple) ou encore des plugins directement en Java. Il existe d'ailleurs de nombreux plugins et macros réalisés par les utilisateur et mis à disposition de la communauté.

Prétraitements
ImageJ est capable de lire des fichier FITS et également d'enregistrer au format FITS, employé en astronomie.
1- Telecharger des images sur le site du Falkes telescope (lien çi-dessous) et les decompresser
2- Les ouvrir avec ImageJ. Les images sont en 16bits . Dans la version installée sur mon PC, ces images sont codées de -32767 à 32767 (format 16bit signé). Il faut au préalable repasser tous les niveaux de gris en valeurs positive : Image->Math->add 32767 . Convertir en 32 bits (image->type->32bits).
3- Modifier le contraste pour un affichage visuel convenable : image->adjust->brightness&contrast->auto. Ou encore, faire une transformation en log à l'aide de image->Math->Log, puis modifier le contraste comme précedemment.
4- Retransformer les images en 8bits et sauver en JPEG ou TIFF

Couleur
1- Image->Color->RGB merge (selectionner composite et keep source, c'est toujours préférable).
2- Modifier le contraste de chacun des plans RGB (contrast auto, commme précedemment).
3- Sauver l'image ou stack2RGB.
4- Utiliser le plugin align RGB planes (si je retrouve ou je l'ai eu je mettrais le lien, probablement sur la page de ImageJ) pour recaler les 3 couleurs.
5- Et c'est fini!!!! Eventuellement utiliser image->crop pour rogner les bords dus au recalage des plans RGB.